Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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