Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWZ1

Rad1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad1Q9QWZ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad1Q9QWZ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad1Q9QWZ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms