Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt17Q9QWL7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt17Q9QWL7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms