Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rai2Q9QVY8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rai2Q9QVY8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms