Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tcea2Q9QVN7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcea2Q9QVN7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms