Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms