Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms