Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrfQ9JM73 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms