Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rabgef1Q9JM13 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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