Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot9Q9JKY0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms