Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms