Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Habp4Q9JKS5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Habp4Q9JKS5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Habp4Q9JKS5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Habp4Q9JKS5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Habp4Q9JKS5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Habp4Q9JKS5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms