Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nova1Q9JKN6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms