Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rcl1Q9JJT0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rcl1Q9JJT0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rcl1Q9JJT0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rcl1Q9JJT0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rcl1Q9JJT0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rcl1Q9JJT0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rcl1Q9JJT0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rcl1Q9JJT0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcl1Q9JJT0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms