Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Copb1Q9JIF7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms