Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2ird1Q9JI57 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms