Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RabggtaQ9JHK4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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