Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Brd4Q9ESU6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
Brd4Q9ESU6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Brd4Q9ESU6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms