Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem27Q9ESG4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms