Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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