Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms