Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ripk4Q9ERK0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ripk4Q9ERK0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms