Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc28a3Q9ERH8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms