Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scn4aQ9ER60 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn4aQ9ER60 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn4aQ9ER60 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms