Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef4Q9EQZ6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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