Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Ndst3Q9EQH7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Ndst3Q9EQH7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Ndst3Q9EQH7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Ndst3Q9EQH7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndst3Q9EQH7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ndst3Q9EQH7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ndst3Q9EQH7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ndst3Q9EQH7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ndst3Q9EQH7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ndst3Q9EQH7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ndst3Q9EQH7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ndst3Q9EQH7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Ndst3Q9EQH7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ndst3Q9EQH7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ndst3Q9EQH7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndst3Q9EQH7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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