Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pold3Q9EQ28 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pold3Q9EQ28 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pold3Q9EQ28 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pold3Q9EQ28 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms