Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl4Q9DCU6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.71■□□□□ 0.74
Mrpl4Q9DCU6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl4Q9DCU6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl4Q9DCU6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl4Q9DCU6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl4Q9DCU6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl4Q9DCU6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl4Q9DCU6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl4Q9DCU6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl4Q9DCU6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl4Q9DCU6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.5 ms