Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms