Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms