Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms