Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtr1Q9DBC3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtr1Q9DBC3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms