Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fundc1Q9DB70 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fundc1Q9DB70 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fundc1Q9DB70 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fundc1Q9DB70 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fundc1Q9DB70 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms