Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer4bQ9D9F7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer4bQ9D9F7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4bQ9D9F7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms