Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C7

Uncharacterized protein C3orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9C7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D9C7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D9C7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms