Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Alkbh4Q9D8F1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Alkbh4Q9D8F1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Alkbh4Q9D8F1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Alkbh4Q9D8F1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Alkbh4Q9D8F1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Alkbh4Q9D8F1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Alkbh4Q9D8F1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Alkbh4Q9D8F1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Alkbh4Q9D8F1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Alkbh4Q9D8F1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms