Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn9Q9D805 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn9Q9D805 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn9Q9D805 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn9Q9D805 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn9Q9D805 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms