Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slx4ipQ9D7Y9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms