Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp5Q9D7S9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp5Q9D7S9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms