Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capns2Q9D7J7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
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