Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms