Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl40Q9D783 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms