Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13Q9D777 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf13Q9D777 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf13Q9D777 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms