Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb8Q9D6J5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms