Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip1Q9D620 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Rab11fip1Q9D620 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Rab11fip1Q9D620 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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