Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn11Q9D572 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn11Q9D572 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms