Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc7Q9D541 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7Q9D541 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms