Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1dQ9D4V4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1dQ9D4V4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1dQ9D4V4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1dQ9D4V4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms