Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931423N10RikQ9D4J9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms