Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gcc1Q9D4H2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcc1Q9D4H2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms